Ibm blue gene помогает ученым в поиске новых вакцин против вич

31 августа 2010

smart

Исследователи из университета Эдинбурга (University of Edinburgh) и научного центра IBM имени Т. Дж. Уотсона (IBM TJ Watson Research Center) заявили сейчас о запуске совместного 5-летнего проекта, целью которого есть ускорение разработки лекарств, мешающих распространению СПИДа (HIV, ВИЧ). Проект предусматривает, наровне с проведением лабораторных опытов, использование суперкомпьютера для моделирования процессов, происходящих на клеточном уровне.

В проекте,реализуемом в рамках сотрудничества университета Эдинбурга и IBM,предполагается применение замечательных вычислительных разработок, в частности — суперкомпьютера IBM Blue Gene, в сочетании с новой экспериментальной методикой. Главные упрочнения будут сконцентрированы на изучении фактически процесса инфицирования методом разработки ингибиторов (замедлителей химических биологических процессов и реакций) для той части СПИДа, что несёт ответственность за внедрение генетического материала ВИЧ в людскую клетку.

В частности, планируется использование атомистических способов моделирования и особого ПО, делаемого на суперкомпьютере с массовым параллелизмом IBM BlueGene/L в комбинации с точными экспериментальными методиками для малых свойств пептидов и исследования аминокислот («строительных блоков белка»). Результаты этих изучений будут играться важную роль в создании нового способа противовирусной терапии, основанного на одновременной разработке множества лекарств для комплексной борьбы с мутирующим вирусом.

«Первые результаты, полученные нами, очень обнадеживают. Они подтверждают возможность применения моделирования процессов на компьютере, дабы определить, какие конкретно молекулы ингибиторов способны остановить вирус ВИЧ и не допустить заражение людей.

Эти сведенья смогут быть после этого использованы фармацевтическими компаниями для стремительной разработки соответствующих лекарств», — отметил Джейсон Крейн (Jason Crain) из физического факультета (School of Physics) Университета Эдинбурга, научный руководитель отделения (Divisional Head of Science) Национальной физической лаборатории Англии (National Physical Laboratory). Он утвержает, что это принципиально новый подход в создании лекарств. Сложные методы моделирования употребляются в сочетании с экспериментальными методиками для разработки улучшенных способов лечения.

«Одна из наиболее значимых задач современной медицины пребывает в поиске вакцины против вируса СПИД, — подчеркивает исследователь из IBM Гленн Мартуна (Glenn Martyna). — Сочетая экспериментальные изучения университета Эдинбурга с возможностями моделирования на самом замечательном в мире суперкомпьютере IBM Blue Gene, мы сможем еще ближе приблизиться к данной цели».

Напомним, что это не первый глобальный проект по борьбе со СПИДом, в котором примет участие IBM. В прошедшем сезоне исследовательская лаборатория IBM в Хайфе (IBM Haifa Research Laboratories) в сотрудничестве с группой патнер из Евросоюза создала интегрированную совокупность лечения СПИДа называющиеся EUResist. Благодаря интеграции баз данных и передовых средств анализа данных, совокупность EUResist может прогнозировать реакцию генетических модификаций ВИЧ на определенную противовирусную терапию.

Возможности EUResist, так, разрешат докторам выбирать самые эффективные их комбинации и лекарства, и оптимизировать способы лечения.